制药工程专业成立于2004年，专业本着“实基础，宽口径，强能力，重创新”的原则合理设置理论与实践课程，构建了“工科”的理论教学体系，突出制药工程专业实践能力的培养；培养学生具有扎实的制药工程专业理论基础、实践能力和较强的创新精神、创业意识，具有利用制药工程专业知识发现、分析、解决复杂工程问题的能力，毕业后能在医药及相关领域的生产企业、科研院所和管理部门从事工程设计、产品研制与开发、生产运行与管理等工作的现代工程师和管理者。现有专兼职教师18名，其中博士5人，双师型教师4名，教授1名，副教授8名。2017-2020年，专业学生主持立项大学陈创新项目19项，其中国家级项目6项，省级项目11项，校级项目2项。采取校企合作“3+1”人才培养模式，到企业“顶岗实习”，着力学生专业技能培训，将课堂教学与岗位培训相结合、专业教育与企业实训相融合，提高了学生创新、创业及实践能力。毕业生可在制药工程(或医药生物技术)领域相关的生产、营销、药品监督管理部门等企、事业单位从事药品生产、管理、营销、检验监督和研发等工作，或继续攻读药学、生物技术及相关专业的研究生。